巨大的消費市場及廣闊的發展空間，讓羅非魚加工產業發展十分迅猛。然而，該行業發展也面臨很多不利因素，其中包括適漁資源日趨減少、技術性貿易壁壘以及人民幣升值。

適漁資源日趨減少

前瞻產業研究院資料顯示，羅非魚作為熱帶性魚類，其最適生長水溫為22℃-35℃，生存臨界最低水溫為9℃左右，因此養殖有明顯的區域性特征。中國、東南亞、中美洲、非洲等為全球羅非魚的主要產區，我國羅非魚則主要集中于廣東、海南、廣西、福建四省。

隨著工業發展和城市化進程的加快，部分適漁資源被污染或侵占，養殖區域受到擠壓，長期來看適宜養殖的資源有逐步減少的趨勢。

技術性貿易壁壘

作為水產加工食品主要消費區域的歐美發達國家普遍對食品衛生安全要求非常嚴格甚至苛刻，普遍就產品的衛生、檢驗檢疫制度、商品標記制度、對進口企業的注冊制度和認證體系等作了種種規定，對不符合條件的商品采取不準進口、或者全部退回的政策。部分國家在特定時期可能會出于貿易保護的需求而采取如綠色壁壘、技術性壁壘等各類非關稅壁壘，導致我國水產品在出口過程中可能遭受到各種各樣不公平待遇，對我國水產業的發展造成不利的影響。

人民幣升值

目前羅非魚加工產品主要銷往國外，由于國際貿易中主要采取美元結算，存在一定的結算期，如加工企業不能有效將人民幣升值的風險轉移給進口商，將會產生一定的匯兌損失。因此，持續的人民幣升值將對低附加值出口加工企業產生較大影響。